Bei dem Versuch, Cole aus der Unterwelt zu befreien, sind die Ninja selbst zu Gefangenen des bösen Zauberers geworden. Zusammen versuchen die Freunde, einen Ausweg aus dem Schacht zu finden. Das Problem dabei sind die Geckles und Munks, die in der Mine schuften. Beide sind sich spinnefeind, seit sie sich vor Urzeiten über zwei magische Klingen zerstritten haben.
